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医疗废物有着多的传染性、致病性的物品，故而应盛放在医用垃圾桶里，妥善处置。然而在宠物医院的宠物医疗垃圾却依旧当做普通垃圾处理，这是危险的。
事实上，对宠物医院的医疗废物，其处理严格程度不亚于人类医院的处理手段。动物诊疗机构产生的医疗废弃物，携带大量病原微生物、寄生虫及其他传染性、有毒有害物质，易造成环境污染和人体健康危害，成为疫病流行源头。因此，这些废弃物不能随意处置，要由正规的专业资质单位进行处理。
杭州一位传染病疾控防疫专家说，宠物医院医疗废物随手一扔，或与生活垃圾一起倾倒的后果严重。
“宠物医院每天收治病猫、病犬，所使用的一次性针管、注射器以及纱布等医疗废物，若得不到、及时处置，那么处理废物的人就会暴露在风险中，形成公共卫生的重大风险。”
为了提高各家动物诊疗机构规范经营意识，绍兴市还举行了所有动物诊疗机构负责人培训班，邀请浙江大学动物院小动物诊疗方面的专家，重点讲解动物诊疗管理相关法律法规制度，动物诊疗等机构经营管理和规范化执业以及医疗废物(废水)规范处置等内容。业务培训切实增强了动物诊疗机构主体责任意识、守法经营意识，提升动物诊疗行业规范化水平。
绍兴市农业农村局还与生态环保、卫生健康、市场监管等多部门进行对接，建立联动机制。与该市市场监管局联合制定《宠物美容、用品店及诊疗机构守法经营告知书》，与市生态环保局建立起管理协作机制，进一步建立健全动物诊疗行业监管的长效机制。
